Jürgen Helm studierte Humanmedizin und Evangelische Theologie in Göttingen und Marburg, war danach Referent bei der Studienstiftung des deutschen Volkes in Bonn-Bad Godesberg. 1992 Promotion zum Dr. med., seit 1993 wissenschaftlicher Mitarbeiter/Assistent/Oberassistent am Institut für Geschichte und Ethik der Medizin der Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg. Geschäftsführer der Ethik-Kommission der Universität Halle. 2004 Habilitation für die Fächer Geschichte und Ethik der Medizin.
Forschungsschwerpunkte: Medizinische Theorie und Praxis in der Frühen Neuzeit; Pietismus und Medizin im 18. Jahrhundert; Geschichte der Anatomie.